东北航空公司建于2006年，2007年11月8日正式开航，是由沈阳中瑞投资有限公司、四川航空集团公司、沈阳市政府国有资产监督管理委员会、辽宁寰江实业有限公司4家股东共同投资组建，投资总额3.6亿元人民币，注册资金1.6亿元人民币。公司总部和主营基地设在沈阳桃仙国际机场，主要经营国内客、货、邮航空运输及相关业务，视情扩展通用航空业务，将逐步发展成为干、支线航空运输相结合，城乡服务于一体的综合性航空企业。公司运营初始阶段投入一架A319、两架ERJ145支线飞机。首期开通的航线为沈阳至哈尔滨、佳木斯、牡丹江、齐齐哈尔、青岛、烟台、天津等支线航线以及沈阳至成都、重庆、温州等干线航线。
　　
　　 12月起，东北航空公司正式放弃原来的沈阳总部，停飞所有原沈阳的航线，将2架ERJ-145客机调机桂林，并开通了桂林，南宁，北海，百色，三亚，贵阳，重庆等城市之间的支线航班，标志着桂林国际机场迎来了第2家属于自己的基地航空公司，此前南方航空广西公司在桂林机场设置有过夜基地，投放4架客机的运力。